不具備手術時機或手術條件的嬰幼兒型內斜視患兒，可采用短小交替遮蓋法。對不能配合遮蓋的患兒則用阿托品交替擴瞳法，使其變為交叉注視，以預防弱視的發生。
1.非手術治療
（1）屈光矯正 能配合戴鏡，且有中度以上遠視者，首先戴鏡矯正，戴鏡2個月內斜度無變化者，應考慮手術。
（2）藥物注射療法 注射A型肉毒桿菌毒素對眼外肌進行化學去神經治療，注射毒素后的肌肉會產生暫時性的麻痹。
2.手術治療
手術方法：采用雙眼內直肌后退術。對斜度≥60△，且有單眼弱視者可采用雙眼內直肌后退加弱視眼外直肌縮短術。內直肌后退量5～7mm。對合并DVD者，則要根據斜視度的大小及出現頻率來決定是否手術。對已過發生弱視年齡的兒童一眼有DVD，且雙眼視力相近或相等者，可用壓抑療法或主眼用散瞳劑，以改變注視眼，若能獲得美容矯正，則不必手術。對DVD明顯且合并下斜肌功能過強者，可用上直肌后退，或聯合下斜肌轉位術矯正。但對嬰幼兒型內斜視手術很難一次獲取正位，需觀察數年后，根據眼位再次手術。