小兒手-心畸形綜合征無有效根治方法，可行外科矯治手術。
1、手部畸形
需根據畸形程度、類型制定手術矯形方案。
2、心血管畸形
尤其是心房、室間隔缺損，宜做修補術。
3、并發癥治療
對并發癥如亞急性細菌性心內膜炎或充血性心力衰竭，按常規予以徹底治療。感染性心內膜炎應及時應用足量、有效、長療程抗生素，以防止瓣膜損毀，防止心功能減退。盡量減輕心臟負荷，包括休息、低鹽飲食，適當應用鎮靜藥、限制活動等。
