目前，只要及早診斷，術前仔細分型，細心手術加上術前和術后的化療，則預后大為改觀。近年來，5年治愈率有明顯提高。即使有肺部單一結節的轉移，如能切除，5年生存率仍可大于40%。
比較一致的觀點是，骨肉瘤一旦經病理證實，就應該立即開始前期的化學治療。切除腫瘤組織是骨肉瘤治療中最為重要和迫切的任務。近年來隨著腫瘤外科技術的提高和內置物研究的發展，肢體保存療法顯示了較好的治療前景。
腫瘤組織切除后的鞏固性化學治療對控制腫瘤轉移，提高治療生存率非常重要。一般在手術治療施行后繼續進行，并做好隨訪工作。
治療骨肉瘤應行根治手術。有條件的病例可做局部廣泛切除而保留肢體。此外，截肢前要做活體組織檢查，以進一步證實臨床和X線診斷。為了防止腫瘤擴散可用電刀操作。
放療和化療均為重要的輔助治療。放射治療宜分成幾個階段：
①活檢前1000～2000Gy共5～6天，最后1天為進行活檢的日期。隨后在截肢前后給6000～8000rad。
②化學治療包括選用大劑量甲氨蝶呤（MTX）、亞葉酸鈣（甲酰四氫葉酸）、多柔比星（阿霉素）、博來霉素（爭光霉素）、放線菌素D（更生霉素）作為復合劑應用。
免疫治療為靜脈輸入淋巴細胞或用干擾素和轉移因子，但效果尚未肯定。