左側卵巢囊腫的治療之前首先一定要先確定是良性還是惡性，手術是治療卵巢囊腫的唯一辦法。如果確定是良性，囊腫又很小的話，可以先觀察，不做治療。
左側卵巢囊腫的治療可以使用卵巢囊腫蒂扭轉，確診后需緊急手術，先肌肉注射鎮痛劑，如度冷丁，不論患者年齡大小，以行患側附件切除術為宜。同時，現在最先進的是現在非常流行的腹腔鏡手術。
雖然左側卵巢囊腫多為良性，但是也有惡變的可能，因此不要麻痹大意，左側卵巢囊腫的治療方法要積極配合醫生進行。預防包括左側卵巢囊腫在內的各種疾病,主要是生活要規律，
腹腔鏡技術治療優勢
腹腔鏡技術，醫生能一目了然、清楚直觀地發現男科婦科疾病和不孕原因并施行手術，檢查、治療同時進行，將創傷減低至最低限度，安全，無痛苦。與傳統手術需要大切口相比，宮、腹腔鏡聯合手術僅需3厘米大小的切口，患者在不知不覺中便完成了手術。切口小，受的損傷也少，術后恢復就更快，一般2天左右就可出院。
傳統中醫中藥治療
中醫認為該病主要與痰瘀有關 ,痰濁阻遏經脈，影響沖任，致使經血不調，運行不暢，胞宮失養，痰濁阻滯氣機升降，影響水液代謝，痰瘀是產生子宮內膜異位癥癥狀和體征的關鍵。中藥針對氣滯血瘀、寒凝血滯、痰飲與血瘀等不同癥狀，都能起到疏肝理氣、活血化瘀、清熱解毒、軟堅散結的作用，從而達到徹底治愈卵巢囊腫的目的。