1、非手術治療急性尿道綜合癥：
以藥物治療為主。一般先給抗菌藥物，按下尿路感染治療(參見尿路感染節)。對癥治療以緩解膀胱刺激癥狀，可給黃酮哌酯鹽酸鹽(商品名：津源靈)或丙胺太林(普魯本辛)等。鈣拮抗藥維拉帕米(異搏定)等解除膀胱刺激癥狀也有一定的作用。對絕經婦女可予小劑量雌激素常可取得很好的療效。尿道擴張治療——每周一次，尿道探桿從Frl8開始直到能維持Fr30，對有尿道括約肌痙攣或尿道遠端梗阻者能明顯改善癥狀。
2、急性尿道綜合癥的手術治療：
主要是針對尿道口形狀變異者，根據不同情況分別作尿道外口的整形術，如尿道處女膜融合者行尿道口陰道口間距延長術，應使尿道口與陰道口之間有0．5-1．Ocm的距離；有處女膜傘者則將處女膜切除；尿道遠端狹窄者行尿道內切開或尿道外切開術。