1.抗生素的應用
應用抗生素的原則：早期應用；足量用藥；靜脈用藥為主；病原微生物不明時選用針對金黃色葡萄球菌、鏈球菌和革蘭陰性桿菌均有效的廣譜抗生素；已分離出病原微生物時，應根據致病微生物對藥物的敏感性選擇抗微生物藥物。
2.手術治療
下述情況需考慮手術治療：
①瓣膜穿孔、破裂，腱索離斷，發生難治性急性心力衰竭；
②人工瓣膜置換術后感染，內科治療不能控制；
③并發性栓塞或化膿性并發癥，如化膿性心包炎、心肌膿腫等；
④其他藥物不能控制的感染，尤其是真菌性和抗生素耐藥的革蘭陰性桿菌心內膜炎；
④心臟起搏器感染性心內膜炎主張手術取出感染的電極導線。