需保持尿路通暢，作全面詳細的泌尿系檢查，發現及處理尿路感染的病因，主要是解除梗阻，控制原發病灶，使尿路暢通。如解除尿路梗阻、去除膀胱內異物、結石等；對女性反復發生膀胱炎應進行婦科檢查，以排除和治療女性生殖道炎癥；對上尿路炎癥、男性生殖器官炎癥如前列腺炎等，均應同時積極處理。對神經系統疾病引起的尿潴留或膀胱炎，根據其功能類型進行治療。
應用敏感抗菌藥物，以口服藥物為主，治療用藥劑量要足、時間要長，一般要應用至癥狀消退、尿常規正常后再繼續使用1～2周。尿培養陰性后，給予1/2量抗生素1～2周，再次尿培養陰性后停藥。癥狀反復者可聯合用藥，一般4～6周，甚至長達6個月。治療過程中要經常進行尿細菌培養及藥物敏感試驗，隨時調整對細菌敏感的藥物，以期早日徹底治愈，以防復發。