以禁食、維持水電解質和酸堿平衡、營養支持及對癥治療為主。近年來由于廣泛應用全靜脈營養，加強支持療法，使本病的預后大大改善。
1.禁食
（1）禁食時間 一旦確診應立即禁食，輕者5～10天，重者10～15天或更長。腹脹明顯時給予胃腸減壓。
（2）恢復進食標準 腹脹消失，大便潛血轉陰，腹部X線平片正常，一般狀況明顯好轉。如進食后患兒又出現腹脹、嘔吐等癥狀，則需再次禁食。
（3）喂養品 開始進食時，先試喂5%糖水，2～3次后如無嘔吐及腹脹，可改喂稀釋的乳汁，以母乳最好，切忌用高滲乳汁。
2.靜脈補充液體及維持營養
禁食期間必須靜脈補液，維持水電解質及酸堿平衡，營養支持。
（1）液量 根據日齡每日總液量為100～150ml/kg。
（2）熱卡 病初保證每日209.2kJ/kg（50kcal/kg），以后逐漸增加至418.4～502.1kJ/kg（100～120kcal/kg）。其中40%～50%由碳水化合物提供，45%～50%由脂肪提供，10%～15%由氨基酸提供。
（3）碳水化合物 一般用葡萄糖周圍靜脈輸注。
（4）蛋白質 輸注氨基酸的主要目的是在保證熱量的前提下，有利于蛋白質的合成。
（5）脂肪 常用10%脂肪乳注射液輸注。
（6）電解質 應監測血電解質濃度，隨時調整。
（7）其他 各種微量元素及維生素
3.抗感染
常用氨芐青霉素及丁胺卡那霉素，也可根據培養藥敏選擇抗生素。
4.對癥治療
病情嚴重伴休克者應及時治療，擴容除用2：1含鈉液外，還可用血漿、白蛋白、10%低分子右旋糖酐。
5.外科治療指征
腸穿孔、腹膜炎癥狀體征明顯，腹壁明顯紅腫或經內科治療無效者應行手術治療。