非手術療法如用腐蝕劑燒灼瘺管效果欠佳，一般主張手術徹底切除。其手術方法：
1.患者仰臥，肩下墊枕，頭后仰。
2.切口在囊腫最隆起處，順皮紋做橫切口，如有瘺管則圍繞瘺口做橫梭形切口，分離上、下皮片。
3.暴露囊腫及分離瘺管，縱行分離胸舌骨肌，暴露出囊腫包膜。為確定瘺管的行程及深度，由瘺管口或囊腫內注入美藍，以組織鉗抓住囊腫或瘺管的皮膚開口向舌骨方向分離，術中應注意不要傷及喉上神經及血管。
4.切除舌骨中部，分離至舌骨體時，仔細檢查管道盲端是否止于此處，若止于此處則將瘺管與囊腫一并切除。沿中線剪開舌骨舌肌，順瘺管向舌體深部分離至舌根。此時食指伸入口內將舌根盲孔推向前下，在手術野后方可見一突起點，此時瘺管的終點，將瘺管剪除，以腸線縫合舌盲孔處缺損。
5.逐層縫合切口，并置橡皮引流條。
6.術后應注意清潔口腔和用抗生素或磺胺藥控制感染。