治療真性紅細胞增多癥目的是盡快使血容量及紅細胞容量接近正常，抑制骨髓造血功能，從而緩解病情，減少并發癥。
1.靜脈放血
可在較短時間內使血容量降至正常，癥狀減輕，減少出血及血栓形成機會。每隔2～3天放血200～400ml，直至紅細胞數在6.0×1012/L以下，紅細胞壓積在50%以下。放血一次可維持療效1個月以上。本法簡便，可先采用。較年輕患者，如無血栓并發癥，可單獨放血治療。但放血后有引起紅細胞及血小板反跳性增高的可能，反復放血又有加重缺鐵的傾向，宜加注意。對老年及有心血管疾患者，放血要謹慎，一次不宜超過200～300ml，間隔期可稍延長。血細胞分離可單采大量紅細胞，但應補充與單采等容積的同型血漿，放血時應同時靜脈補液，以稀釋血液。
2.真性紅細胞增多癥的化療治療：
（1）羥基脲 系一種核糖核酸還原酶，對真性紅細胞增多癥有良好抑制作用，且無致白血病副反應。如白細胞數維持在3.5～5×109/L，可長期間歇應用羥基脲。
（2）烷化劑 有效率80%～85%。環磷酰胺及左旋苯胺酸氮芥（馬法侖）作用較快，緩解期則以白消安及苯丁酸氮芥為長，療效可持續半年左右。苯丁酸氮芥副作用較少，不易引起血小板減少，為其優點。烷化劑也有引起白血病的危險，但較放射性核素為少。
（3）三尖杉酯堿 國內報告應用本品加于10%葡萄糖液中靜脈滴注每日一次，連續或間歇應用到血細胞壓積及血紅蛋白降到正常為止。達到緩解時間平均為60天，中數緩解期超過18個月。
3.真性紅細胞增多癥的α干擾素治療：
干擾素有抑制細胞增殖的作用，近年也已開始用于本病治療。皮下注射治療3個月后脾臟縮小，放血次數減少。緩解率可達80%。
4.放射性核素治療：
32P的β射線能抑制細胞核分裂，使細胞數降低。約6周后紅細胞數開始下降，3～4個月接近正常，癥狀有所緩解，約75%～80%患者有效。如果3個月后病情未緩解，可再給藥一次。緩解時間達2～3年。32P有使病患轉化為白血病的危險，故近年已很少應用。
5.真性紅細胞增多癥的對癥治療：
（1）繼發性痛風性關節炎 服別嘌呤醇、消炎痛治療。
（2）瘙癢 口服賽庚啶、息斯敏或西米替丁。
（3）缺血表現 對伴有肢端或腦缺血表現者，可短期應用抗血小板聚集藥物，如阿司匹林、潘生丁。