1.手術切除
是治療眼瞼基底細胞癌的主要方法，手術切除范圍應足夠大，去除所有腫瘤組織，同時盡可能保留正常眼瞼組織。由于癌細胞向周圍浸潤超出臨床上所顯示的正常邊緣，最好采用Mohs顯微手術技術或術中冷凍切片監測切除標本的邊緣，以確定腫瘤完全切除，防止復發。眼瞼基底細胞癌侵犯眼內者少見，但可向眶內蔓延。如發生眼眶蔓延，應行眶內容切除術。
2.放射治療
大多數基底細胞癌對放射治療有效，尤其是復發病例或病變位于內眥部者可選擇應用。無論哪種放射治療，都應掌握放射劑量，以避免放療并發癥。
3.冷凍療法
適應證為：
（1）有凝血功能障礙或全身病而不能手術者。
（2）患者不同意手術。
（3）痣樣基底細胞癌綜合征。
（4）著色性干皮癥。
（5）腫瘤位于內眥部，手術后易引起功能障礙和畸形者。
（6）硬化型或復發性腫瘤。
冷凍治療的優點為冷凍對病變組織和周圍正常組織有一定區別，因此冷凍后腫瘤消失，但眼瞼不變形或很輕微畸形；由于冷凍阻塞瘤體周圍的血管，可防止癌細胞擴散和轉移。其缺點為治療區皮膚有色素過度沉著和色素脫失現象，留有持久的白斑。
4.光化學療法
是利用光敏劑血卟啉衍生物對瘤細胞有特殊親和力，在激光照射下經過一系列化學反應，發生氧化作用，破壞癌細胞膜，使癌細胞壞死。同時血管基質也受到破壞，使腫瘤發生變性壞死。主要并發癥為過敏反應，日光照射后出現全身腫脹或皮膚發生水皰。