腎盂輸尿管連接部梗阻治療的主要目的是解除梗阻、保護患腎功能。其治療方法主要包括開放性手術和腔內手術兩大類。
1.開放性腎盂輸尿管成形術
采用的治療方法大多為離斷性腎盂成形術。由于該手術能切除病變的腎盂輸尿管連接部以及多余的腎盂壁，建立漏斗狀腎盂和輸尿管連接，恢復肌源性的蠕動，且療效顯著，手術成功率高達85%～90%。因此，被譽為是腎盂輸尿管連接部梗阻治療的“金標準”。
2.腔內腎盂輸尿管成形術
隨著腔內手術器械和手術方法的改進，腔內手術治療腎盂輸尿管連接部梗阻的成功率已逐漸接近開放手術。腔內手術具有創傷小、恢復快、并發癥少等優點，有望成為治療成人腎盂輸尿管連接部梗阻的首選方法。常見的腔內手術有腹腔鏡腎盂成形術、經皮腎穿刺腎盂內切開術和輸尿管鏡腎盂內切開術等。但術前明確狹窄段長度超過2cm或有異位血管者不宜行腔鏡下的腎盂內切開術。手術方式主要有以下幾種：①腹腔鏡腎盂裁剪成形術；②經皮腎穿刺腎盂內切開術；③輸尿管鏡腎盂內切開術；④氣囊擴張術。