1.局部首選氨基糖苷類抗生素（慶大霉素、妥布霉素、阿米卡星）頻繁滴眼，也可采用第三代頭孢菌類抗生素（頭孢甲肟、頭孢磺啶、頭孢哌酮）和氟喹諾酮類抗菌藥（氧氟沙星）頻繁或交替滴眼。白天每30～60分鐘滴眼1次。晚上改用氧氟沙星眼膏或磺芐西林眼膏每3～4小時涂眼1次。
2.重癥患者可采用結膜下注射或全身用藥，待獲得藥敏試驗的結果后應及時修正使用敏感的抗生素或抗菌藥進 行治療。糖皮質激素的應用在大量有效抗菌藥控制炎癥的情況下，適當應用糖皮質激素可以減輕炎癥反應和瘢痕形成。口服潑尼松或地塞米松加入抗生素及葡萄糖中靜脈點滴。但潰瘍未愈合熒光素染色陽性時局部忌用糖皮質激素治療。
3.其他治療：用1%阿托品散瞳，用膠原酶抑制劑及大量維生素和對癥治療。病情重者在藥物治療24～48小時后有條件則徹底清除病灶進行板層角膜移植。術后每天結膜下注射敏感抗菌藥可縮短療程挽救眼球。后遺角膜白斑者則作穿透性角膜移植。