1.手術治療
（1）闌尾黏液囊腫的治療以手術切除闌尾為首選，切除時應盡可能保證黏液囊腫完整，避免囊腫破裂，形成腹膜假黏液瘤或造成播散。
（2）對于闌尾根部較細者，與闌尾炎切除術用同樣的方法進行；闌尾根部較粗者，應考慮做部分盲腸切除。
（3）對于囊腫直徑較大的患者，可考慮闌尾系膜和闌尾一起切除，以便于確定淋巴結情況。
（4）對女性患者，應該探查盆腔，如果發現卵巢為假黏液瘤，加行卵巢切除術，附件有種植物應做相應的處理。
2.術中注意事項
（1）一旦囊腫破裂，要馬上吸凈囊內容物，反復沖洗污染部位。
（2）手術操作時應用鹽水巾將手術野與腹腔隔開，以防黏液囊腫破裂沾染腹腔，形成腹腔假黏液瘤。
（3）嚴重粘連的囊壁，禁止強行剝離，而是應該擴大切除范圍。
（4）不宜行囊腫穿刺及囊壁切除行活檢。