隱球菌腦膜炎應立即開始給予有效的抗真菌治療,同時積極處理患者的顱高壓,抗真菌治療一般要求聯合用藥,力爭使腦脊液培養在2周內轉陰;隱球菌肺炎在部分患者中具有自限性,應根據患者具體情況決定是否給予治療;其他播散性隱球菌感染一般要求全身給予抗真菌治療。常用藥物包括:兩性霉素B及其含脂復合制劑、三唑類以及氟胞嘧啶 。