WG可產生嚴重的并發癥，治療如果不及時，將會危及生命。其治療方案與治療結節性多動脈炎性鞏膜炎患者的方案一樣。首選方法為糖皮質激素和細胞毒性免疫抑制劑的聯合應用，目前WG的首選治療方案是美國國立衛生所推薦的糖皮質激素和環磷酰胺的標準方案。尤其不能遺漏免疫抑制劑的應用，因為單用糖皮質激素可發生不可逆轉的器官功能不良。
過去一直認為WG是一個致死性疾病，但用上述治療方案后，90%可獲緩解。臨床上發現限制性WG伴鞏膜炎患者，如果醫生僅選用藥物治療，而未選用細胞毒性免疫抑制劑，患者可由限制性發病形式發展為全身性播散性發病形式，最后可死于WG的多種并發癥。因此，對于WG性鞏膜炎患者，僅使用藥物治療是絕對不夠的。對于WG鞏膜炎局部用1%CsA(環孢素A)眼水或眼膏，同時滴用糖皮質激素，為了防止組織的自溶和感染，配合應用3%半胱氨酸眼水和抗生素眼水遞延，同時需全身應用糖皮質激素和免疫抑制劑。壞死性前鞏膜炎有穿孔傾向或已穿孔時可行鞏膜加固術。伴發邊緣性潰瘍性角膜炎可采用冷凍的眼組織移植，伴發前葡萄膜炎者應進行散瞳治療。
WG全身治療分為誘導緩解期和維持治療期。誘導緩解期用潑尼松（甲潑尼龍），當病情控制后逐步減量；同時聯合環磷酰胺；對誘導緩解反應不佳者聯合使用TNF-α拮抗劑依那西普。維持治療期聯合使用糖皮質激素或甲氨蝶呤。
對無危及生命或器官的WG可聯合使用毒性較小的甲氨蝶呤和糖皮質激素作為誘導緩解治療，而若進展到器官受損或有生命危險需使用環磷酰胺。最大劑量標準治療仍未緩解或再發重型患者應考慮其他免疫調節治療，如TNF-α拮抗劑英夫利昔單抗。