臨床表現
1.念珠菌性龜頭包皮炎 易發于包皮過長而未做環切術者，常有的癥狀是包皮內板及龜頭輕度潮紅，干燥光滑，包皮內板及冠狀溝處伴有白色奶酪樣斑片，有的表現為淺紅色糜爛及薄壁膿皰，刺癢明顯，也可見包皮及龜頭潮紅，可見散在性小丘疹，當陰囊被侵犯時，在與陰莖接觸面上可見鱗屑性紅斑，尿道口舟狀窩受累時，可產生尿頻，尿痛。
2.下尿路念珠菌病 包括輸尿管，膀胱及尿道等念珠菌病，本病大多數均由留滯的尿道插管或生殖道及胃腸道局部播散所致，多見于糖尿病及伴有尿路異常或損傷的患者，累及輸尿管，膀胱或尿道時臨床表現各異，但均與細菌感染不同，許多患者可只有念珠菌尿癥而無任何癥狀，白念珠菌仍是本病最主要的病原菌，但對抗真菌治療耐藥的光滑念珠菌感染也多達30%。
3.腎念珠菌病 本病由血行播散所致的遠比上行性感染所致者多見，至少80%的播散性念珠菌病患者會發生腎念珠菌病，因此，伴有念珠菌尿癥且有發熱癥狀的中性粒細胞減少癥患者，應懷疑播散性念珠菌病，主要癥狀有發熱，寒戰，腰痛和腹痛，少尿或無尿是嬰兒感染的常見體征，除了腎盂和輸尿管的真菌球可表現為放射線透明性的不規則充填缺損外，無特異性影像學特征。
鑒別
1.腎盂癌 可有腎積水，尿路造影顯示出腎盂充盈缺損與腎臟真菌感染有相似之處，但腎盂癌病人多有全程性，無痛性肉眼血尿，易通過B超，CT檢查發現腎盂內占位病變，輸尿管鏡，膀胱鏡檢查可見腎盂腫瘤以及膀胱種植的腫瘤。
2.急性腎盂腎炎 亦有發熱，腰痛，血尿等臨床表現，但無消耗性疾病史，無尿“真菌球”病史，尿沉渣涂片和尿培養可發現致病細菌，但無真菌絲和真菌生長。
3.泌尿系陰性結石 真菌感染時，因尿中排出白色真菌塊引起急性輸尿管梗阻，而導致腎絞痛發作，有時易誤認為泌尿系陰性結石，但尿沉渣中不能查見假菌絲及孢子，有時可查到尿鹽結晶，B超檢查可見結石強光團伴聲影，如能收集到真菌球，做病理檢查可明確診斷。
4.慢性膀胱炎 有反復發作的膀胱刺激癥狀，與真菌性膀胱炎有相似之處，但尿液中一般無白色塊狀物漂浮或沉淀，尿沉渣鏡檢僅看到白細胞，膿細胞或紅細胞，無真菌孢子和菌絲，中段尿培養有非特異性細菌生長，依此可加以鑒別。