為了使無塵室內保持所需要的溫度、濕度、風速、壓力和潔凈度等參數，常用的方法是向室內不斷送入一定量經過處理的空氣，以消除無塵室內外各種熱濕干擾及塵埃污染，為獲得送入無塵室具有一定狀態的空氣，就需要一整套設備對空氣進行處理，并不斷送入室內，又不斷從室內排出一部分來，這一整套設備就構成了凈化空調系統。
一、凈化空調系統的基本構成
凈化空調系統所用的設備按作用大致可分為三類:
1、加熱或冷卻，加濕或去濕以及凈化設備。
2、將處理后的空氣送入各無塵室并使之循環的空氣輸送設備及其管路。
3、向系統提供熱量，冷量的熱、冷源及其管路系統。
二、凈化空調系統的分類
凈化空調系統一般分為三大類：
1、集中式凈化空調系統
在系統內單個或多個潔凈室所需的凈化空調設備都集中在機房內，用送風管道將潔凈空氣配給各個無塵室。
2、分散式凈化空調系統
在系統內各個無塵室分別單獨設置凈化設備或凈化空調設備。
3、半集中式凈化空調系統
在這種系統中，即有集中的凈化空調機房，又有分散在各無塵室內的空氣處理設備，是一種集中處理和局部處理相結合的形式。
人們一般按系統內各無塵室的潔凈度來命名系統，如稱之為100級凈化空調系統，1000級凈化空調系統等。
有時也按系統的末級過濾器的性質來區分，分為高效空氣凈化系統，亞高效空氣凈化系統和中效空氣凈化系統。（下圖為空調機組示意圖）
三、凈化空調系統的消毒方法
注意：消毒前確認潔凈區內所有人員已經撤出，生產處于停止狀態。
1.臭氧消毒
消毒方式為臭氧發生器產生一定濃度臭氧，由風機風管帶入潔凈區內進行消毒。臭氧消毒一般在無人情況下進行，目前我國藥廠都是沿用臭氧對空調通風系統進行消毒。公共場所為人群聚集的場所，一般不選用單獨的臭氧消毒方法。
2.紫外線消毒
紫外線照射對靜止的物體或空氣消毒具有十分可靠的效果, 但紫外線穿透性較差, 遮擋角落不易被消毒; 且紫外線沒有除塵作用，空氣中的塵埃粒子可能會影響其消毒效果。