一．開機程序
1 ．檢查穩壓器電源，打開電源，穩定5分鐘。
2 ．打開儲液箱，倒掉廢液,并在廢液桶中加入400ml漂白水原液。打開壓力閥，取出鞘液桶，將鞘液桶加至4/5滿（一般可用三蒸水，做分選必須用PBS或FACSFlow），合上壓力閥。確實蓋緊桶蓋，檢查所有管路是否妥善安置。
3 ．將FACSCalibur開關打開，此時儀器功能控制鈕的顯示應是STANDBY，預熱5－10分鐘。排出過濾器內的氣泡。
4 ．如果需要打印，打開打印機電源。
5 ．打開電腦,等待屏幕顯示出標準的蘋果標志。
6 ．執行儀器PRIME功能一次，以排除Flowcell中的氣泡。
7 ．分析樣品時，先用FACAFlow或PBS進行HIGHRUN約2分鐘。
X.做過分選后，每次開機后需沖洗管道：向分選裝置上裝上兩個50ml離心管，不接通濃縮系統，摁下右下角白色按鈕開始沖洗。待自動停止后接通濃縮裝置，同上法沖洗一次。
二．預設獲取模式文件(AcquisitionTemplateFiles)
1 ．從蘋果標志中選擇CELLQuest見一個新視窗，可利用此視窗編輯一個獲取模式文件。
2 ．選取屏幕左列繪圖工具中的Dotplot，繪出一個或多個DotPlots（點圖）。從DotPlot對話框中選取Acquisition作為圖形資料來源，并確定適當的x軸和y軸參數。
3 ．選取屏幕左列繪圖工具中的Histogram，同上法可繪出Histogram（直方圖）。
4 ．將此視窗命名后儲存于FACStationG3\BDApplications\CELLQuestFolder\EXP文件夾中，下次進行相同實驗時可直接調用。
X.本計算機中已設定兩個模式文件：ACQ和EXP，儲存于FACStationG3\BDApplications\CELLQuest\EXP文件夾中，ACQ用于細胞DNA檢測，EXP用于細胞表面標志分析。