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  • 發布時間:2019-09-30 16:52 原文鏈接: 流式細胞術應用|病毒細菌藻類絕對計數

    實驗簡介

    噬藻體是水體中常見的浮游病毒,具有控制有害藻華、調節水生態結構、以納米尺度驅動全球生物地球化學循環、特別是碳循環的一類不可忽視的戰略生物資源;異彎藻是水體中的常見藻類,在適宜的溫度下會大量生長,曾在大連灣、膠州灣等曾多次形成赤潮,對異彎藻計數是水質檢測中常見的檢測項目。

    異彎藻富含葉綠素,葉綠素在藍光激發下有紅色自發熒光;檢測水體中大腸桿菌的含量,常作為水體污染指數的衡量標準。

    本實驗用核酸染料 SYBR green I 染色,借助 CytoFLEX 流式細胞儀對噬藻體、大腸桿菌、異彎藻進行區分,并絕對計數。與傳統的顯微鏡計數及平板菌落計數法等相比,具有速度快,操作簡便,結果準確的優點。

    材料與方法

    ? 試劑

    ? 樣品制備

    Sample Type噬藻體;大腸桿菌;異彎藻
    Species病毒;細菌;藻類
    Age of specimen新鮮樣本
    Prep Method

    1. 準備以下四管樣本:噬藻體、大腸桿菌、異彎藻、三者混合(用 TE-buffer 稀釋);

    2. SYBR green I(Invitrogen,母液液為 10000×,DMSO 稀釋,-20 ℃ 冰箱保存)。使用 時需要將母液稀釋 200 倍使用(超純水稀釋),SYBR Green I 80°避光染色 10 min;

    3. 上機檢測。

    ? 儀器配置

    Instrument ConfigurationVSSC (Yes/No)Plate or Tube Format
    B5-R3-V5YesTube

    數據分析

    1. 建立 FSC/VSSC-Log 雙參數散點圖,SYBR /VSSC-Log 散點圖用于區分病毒與細菌,PC5.5/VSSC-Log 散 點圖用于區分藻類;

    2. 將閾值設定在 SYBR 通道,以 SYBR green I 染色的 TE-buffer 作為對照,界定閾值將雜信號去掉;

    3. 分別檢測以下樣本:A:SYBR green I 染色噬藻體、B:SYBR green I 染色大腸桿菌、C:SYBR green I 染色 的噬藻體、大腸桿菌、異彎藻三者混合樣本。

    實驗結果

    A:SYBR green I 染色噬藻體

    B:SYBR green I 染色大腸桿菌

    C:SYBR green I 染色的三者混合樣本

    CytoFLEX 是第一臺借助 VSSC 可檢測 100 nm 微顆粒的流式細胞儀,在本次實驗中 CytoFLEX 流式細胞儀可通 過熒光信號和 VSSC 對噬藻體病毒進行區分,并以其強大的靈敏性區分 DNA 含量不同的噬藻體與大腸桿菌。 除此之外,CytoFLEX 有自動計數功能,與用戶傳統方式的計數方式做比較,結果一致。


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