接種流行性感冒裂解疫苗后，可以誘導機體產生針對血凝素和神經氨酸酶表面抗原的抗體，這些抗體可以中和流感病毒。
血清中的血凝素抑制滴度不少于1:40時被認為有保護。
具有保護性抗體的濃度通常在2-3周內獲得。由疫苗產生的對于疫苗相同株或類似株的免疫保護持續時間有所不同，通常為6-12個月。由流行性感冒裂解疫苗提供的保護只針對流感病毒的感染，對由其他病原體引起的流感樣癥狀等不起作用。
對2010-2011流感季的血清陽轉率進行評價，包含：甲/加利福尼亞/7/2009 (H1N1)-類似株[甲/加利福尼亞/7/2009 (NYMCX-181)],甲/珀斯/16/2009 (H3N2)-類似株[甲/維多利亞/210/2009 (NYMCX-187)]，乙/布里斯班/60/2008。
接種后的保護率高于歐洲藥典中對流感疫苗的要求（18-60歲成人需>70%；60歲以上老年人需>60%）。