臨床表現
一 多發群體
人類普遍易感，成人多數呈隱性感染。發病多見于10歲以下兒童，以3～6歲兒童發病率最高。據不同報道，發病與隱性感染的比例為1：25-1000。近年來由于兒童和青少年廣泛接種乙腦疫苗，故成人和老人發病相對增多，病死率也高。男性較女性多。約在病后一周可出現中和抗體，它有抗病能力，并可持續存在4年或更久，故二次發病者罕見。
二 疾病癥狀
潛伏期5～15天。大多數患者癥狀較輕或呈無癥狀的隱性感染，僅少數出現中樞神經系統癥狀，表現為高熱、意識障礙、驚厥等。典型病例的病程可分4個階段。
（一）初期：起病急，體溫急劇上升至39～40℃，伴頭痛、惡心和嘔吐，部分病人有嗜睡或精神倦怠，并有頸項輕度強直，病程1～3天。
（二）極期：體溫持續上升，可達40℃以上。初期癥狀逐漸加重，意識明顯障礙，由嗜睡、昏睡乃至昏迷，昏迷越深，持續時間越長，病情越嚴重。神志不清最早可發生在病程第1～2日，但多見于3～8日。重癥患者可出現全身抽搐、強直性痙攣或強直性癱瘓，少數也可軟癱。嚴重患者可因腦實質（尤其是腦干）病變、缺氧、腦水腫及顱內高壓、腦疝、低血鈉性腦病等病變而出現中樞性呼吸衰竭，表現為呼吸節律不規則、雙吸氣、嘆息樣呼吸、呼吸暫停、潮式呼吸和下頜呼吸等，最后呼吸停止。體檢可發現腦膜刺激征，瞳孔對光反應遲鈍、消失或瞳孔散大，腹壁及提睪反射消失，深反射亢進，病理性錐體束征如巴氏征等可呈陽性。
（三）恢復期：極期過后體溫逐漸下降，精神、神經系統癥狀逐日好轉。重癥病人仍可留在神志遲鈍、癡呆、失語、吞咽困難、顏面癱瘓、四肢強直性痙攣或扭轉痙攣等，少數病人也可有軟癱。經過積極治療大多數癥狀可在半年內恢復。
（四）后遺癥期:少數重癥病人半年后仍有精神神經癥狀，稱為后遺癥，主要有意識障礙，癡呆，失語，及肢體癱瘓，癲癇等。如予積極治療可有不同程度的恢復。癲癇后遺癥可持續終生。
三 疾病危害
多數病人經治療后痊愈。少數病例因腦組織病變較重而恢復較慢，有的不能恢復而留有癡呆，語言障礙，肢體癱瘓等后遺癥。病變嚴重者，有時可因中樞性呼吸及/或循環衰竭、或并發小葉性肺炎而死亡。
診斷標準
（一）疑似病例：蚊蟲叮咬季節在乙腦流行地區居住或于發病前25天內曾到過乙腦流行地區，急性起病，發熱、頭痛、嘔吐、嗜睡，有不同程度的意識障礙癥狀和體征的病例。
（二）臨床診斷病例：疑似病例，同時實驗室腦脊液檢測呈非化膿性炎癥改變，顱內壓增高，腦脊液外觀清亮，白細胞增高，多在(50～500)×106/L，早期以多核細胞增高為主，后期以單核細胞增高為主，蛋白輕度增高，糖與氯化物正常。
（三）確診病例：疑似或臨床診斷基礎上，病原學及血清學檢測結果符合下述任一項的病例：
1、1個月內未接種過乙腦疫苗者，血或腦脊液中抗乙腦病毒IgM抗體陽性。
2、恢復期血清中抗乙腦病毒IgG抗體或乙腦病毒中和抗體滴度比急性期有≥4倍升高者，或急性期抗乙腦病毒IgM / IgG抗體陰性，恢復期陽性者。
3、在組織、血液或其它體液中通過直接免疫熒光或聚合酶鏈反應(PCR)檢測到乙腦病毒抗原或特異性核酸。
4、腦脊液、腦組織及血清中分離出乙腦病毒。
（四）排除病例
腦脊液呈非病毒性腦炎表現、或血清學實驗陰性、或能夠證實為其它疾病的疑似病例應排除乙腦診斷。