采取分層診斷原則。流行及大流行期間可根據臨床癥狀進行診斷，但流感早期散發病例要結合流行病學史、臨床表現、實驗室檢查綜合診斷。
需要考慮流感的臨床情況
（1）在流感流行時期，出現下列情況之一，需要考慮是否為流感：
①發熱伴咳嗽和/或咽痛等急性呼吸道癥狀。
②發熱伴原有慢性肺部疾病急性加重。
③嬰幼兒和兒童發熱，未伴其他癥狀和體征。
④老年人（年齡≥65歲）新發生呼吸道癥狀，或出現原有呼吸道癥狀加重，伴或未伴發熱。
⑤重病患者出現發熱或低體溫。
（2）在任何時期，出現發熱伴咳嗽和/或咽痛等急性呼吸道癥狀，并且可以追蹤到與流感相關的流行病學史—如患者發病前7天內曾到有流感暴發的單位或社區；與流感可疑病例共同生活或有密切接觸；從有流感流行的國家或地區旅行歸來等。
需要安排病原學檢查的病例
若有條件，對出現以上情況的病例，可安排病原學檢查以求明確診斷。
對于明確診斷與否會對臨床處理產生影響的病例，宜積極安排病原學檢查。這些病例一般包括：需決定是否應及時啟動抗病毒治療的高危病例；是否確診對安排其他診斷檢查有影響的病例；需決策是否應用抗生素治療的病例；等待診斷結果來安排相應感染控制措施的病例；進行流行病學采樣調查的病例等。