普通感冒：多種病毒引起，多為散發，起病較慢，上呼吸道癥狀明顯，全身癥狀較輕。感冒俗稱傷風，又稱急性鼻炎或上呼吸道卡他，是以鼻咽部卡他癥狀為主要表現。成人多為鼻病毒引起，次為副流感病毒、呼吸道合胞病毒、埃克病毒、柯薩奇病毒等。起病較急，初期有咽干、咽癢或燒灼感，發病同時或數小時后，可有噴嚏、鼻塞、流清水樣鼻涕，2~3天后變稠。可伴咽痛，有時由于耳咽管炎使聽力減退，也可出現流淚、味覺遲鈍、呼吸不暢、聲嘶、少量咳嗽等。一般無發熱及全身癥狀，或僅有低熱、不適、輕度畏寒和頭痛。檢查可見鼻黏膜充血、水腫、有分泌物，咽部輕度充血。如無并發癥，一般5~7天痊愈。 與輕型流感鑒別相對困難，確切鑒別需行病原體的相關檢查（見上文）。普通流感的流感病毒相關檢查呈陰性。
流感傷寒型鉤體病：夏秋季多發，有疫水接觸史，臨床除發熱外，腓腸肌壓痛，腹股溝淋巴結腫大、壓痛，實驗室檢查可通過顯凝實驗檢測抗體，若抗體效價為1：400以上增高，考慮該病，通過血培養可診斷。
其他類型上呼吸道感染：包括急性咽炎、扁桃體炎、鼻炎和鼻竇炎。感染與癥狀主要限于相應部位。局部分泌物流感病原學檢查陰性。急性扁桃體炎咽部紅腫，扁桃體腫大，有膿性分泌物，頜下淋巴結腫大，白細胞總數或中性粒細胞比例增高，血培養可呈陽性，抗菌藥物治療有效。
下呼吸道感染：流感有咳嗽癥狀或合并氣管-支氣管炎時需與急性氣管-支氣管炎相鑒別；合并肺炎時需要與其他肺炎，包括細菌性肺炎、衣原體肺炎、支原體肺炎、病毒性肺炎、真菌性肺炎、肺結核等相鑒別。根據臨床特征可作出初步判斷，病原學檢查可資確診。
其他非感染性疾病： 流感還應與伴有發熱，特別是伴有肺部陰影的非感染性疾病相鑒別，如結締組織病、肺栓塞、肺部腫瘤等。