肺系病的發生發展與痰邪密切相關。比如咳嗽一病，分為外感咳嗽和內傷咳嗽。引起內傷咳嗽的主要病理因素是痰與火，而痰又有寒熱之分。
哮病是肺系病的常見病，其發生的重要機制是痰邪，朱丹溪曾言：“哮喘專主于痰”，從而有“無痰不成哮”一說。苗祥東用健脾除濕的名方參苓白術散治療哮病取得良好療效，肯定了積痰是哮喘發作之源。劉永平整理古代哮病文獻后發現痰在支氣管哮喘發作期是重要的致病因素，緩解期痰的表現雖不明顯，甚至無痰，但體內仍有伏痰，易受多種因素誘發。故痰是哮喘發病的原因。李學良也認為，痰實為哮喘的主要病理基礎，是哮喘發作的中心環節。
喘證的發生，主要臟腑在肺腎，性質分為虛實兩端。其中實喘多由外邪、痰濁、肝郁氣逆，邪壅肺氣，宣降不利所致。黃崇先從痰飲角度論治肺源性心臟病表現為喘證的患者，取得良好療效。認為喘證一病的病機特點是“感邪時偏于標實，平時偏于本虛”，臨床中標實者以痰濁水飲為主。劉建秋對肺間質纖維化表現為中醫喘證的疾病病機進行了探討，認為主要發病機制是氣虛血瘀、痰熱互結。外邪、痰濁、瘀血、熱毒為標實，痰熱壅肺型是常見證型。
肺癰一病，重要的內傷病機即為痰熱素盛。痰阻肺絡，血滯為瘀，導致痰熱與瘀血互結蘊釀成癰，血敗肉腐化膿，肺損絡傷，膿瘍潰破外泄。已故老中醫何任認為，肺癰之證，總由于感受風寒未經發越，停留于肺蘊發為熱，或由濕熱痰濁蒸淫肺竅而成。所以，痰邪在肺癰發病中也有重要機制。
肺脹的發生，緣于多種慢性肺系疾病反復發作，日久不愈，出現肺氣脹滿，失于斂降，最終形成的一種病證。該病的病理因素主要為痰濁、水飲與血瘀互為影響，兼見同病。三種病理因素中痰濁居首，故有人將其病機概括為六個字“肺脾腎，痰水瘀”，所以無痰也不成脹。韓圣賓也認為，肺脹一病病理因素主要為痰濁、水飲與瘀血，兼見同病，早期以痰濁為主，漸而痰瘀并見。黃崇先認為痰飲既是肺脹的病理產物，又是致病因素。曹宗黎認為COPD患者，多為痰濕體質，素體肥胖，又根據“腎為生痰之根”、“脾為生痰之源”、“肺為貯痰之器”及“胃者，五臟之本也”的思想，提出痰飲水濕，同屬一物觀點。單麗囡認為該病主要病理因素為痰濁與瘀血，兩者相互影響，兼見同病，是疾病發生及發展的重要環節。