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  • 發布時間:2013-07-01 13:45 原文鏈接: 測序首次鑒定鯊魚肝臟microRNA組

      條紋斑竹鯊(Chiloscyllium plagiosum),是主要棲息于沿海礁砂混合且海藻繁生的海床中的一種魚類,卵生,對其生活習性我們還不甚了解,可能以底棲無嵴椎動物及小魚為食。條紋斑竹鯊具有一定的經濟價值,可在水族館中展示,食用可治療佝僂病、外痔、 水火燙傷、夜盲癥等。microRNAs(miRNAs)是調控廣泛的生物過程中不可或缺的成員,對條紋斑竹鯊進行miRNA研究有助于我們對這種神秘海洋物種的深入了解。近日,浙江理工大學副教授呂正兵領銜其團隊,對條紋斑竹鯊肝臟中的miRNA組進行了系統研究*。

      研究人員利用測序技術首次對條紋斑竹鯊肝臟中的小RNA,特別是miRNAome進行深度挖掘(小RNA測序技術服務由聯川生物提供)。測序發現,其中91個miRNAs,這些miRNA已在斑馬魚,紅鰭東方鲀,青鳉,非洲爪蟾,熱帶爪蟾,人類,小鼠中報道,可以比對到 Callorhinchus milii基因組。此外,研究人員鑒定到156個新的候選條紋斑竹鯊miRNA。從這247個miRNAs中,研究人員一共鑒定得到39個miRNAs 簇,并且觀察到這些簇的表達顯著不同。研究人員進一步挑選了其中7個候選miRNAs,采用莖環RT-PCR對其表達進行驗證,結果顯示所有7個都在條紋斑竹鯊肝臟中有表達。

      本研究結果,為進一步研究miRNA在條紋斑竹鯊肝臟發育過程中的調控作用奠定了基礎。

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