1、正相色譜柱：固定相極性大于流動相一般指硅膠柱，以正己烷系列為流動相。
2、反相色譜柱：固定相極性小于流動相，其技術就是在硅膠基質上鍵合有機碳鏈。
一般指C18、C8、苯基柱等，以甲醇、乙腈、水為流動相。
目前用的最多的色譜柱是反相色譜柱
反相色譜柱填料合成技術
用四乙氧基硅烷脫乙基聚合成硅膠，并脫去表面的乙基，換成H ,即 Si-OH 基。并造成海綿狀孔型構造，顆粒大小約60-130?;，然后用 Cl-C18 與 Si-OH 鍵合。
端基封口技術是對殘余的Si-OH 用小分子的氯-甲基、氯-乙基鍵合。