在離子源離子化后，離子經過離子傳輸部分（習慣上稱為Q0區）進入后續的質量分析器。最早的ESI在采樣錐后使用了傳輸毛細管，可以進一步離子化，后面再經過六極桿或八極桿進行離子聚焦和傳輸。后來的商品化設計融入了各家的專利設計，比如有的采用加大孔徑的毛細管，有的采用一組加了電壓的錐板。在離子聚焦和傳輸部分，有的用方形四極桿，有的用Q-Jet，有的用離子漏斗（Ion Funnel），有的用ScanWave、StepWave、T-Wave等等。無論設計成何種形態再加上電壓調節，主要目標都是離子聚焦和更好地傳輸。
Ion Funnel
S-lense
T-wave
左：Q-Jet；右：D-Jet
接下來請見下篇：液質聯用中的質譜：質量分析器（上）
目錄：
前言：液質聯用（LC-MS）簡述
Chapter1、液質聯用中的液相色譜
Chapter2、液質聯用中的質譜
2.1離子源
2.2離子傳輸
2.3 質量分析器
2.4串聯質譜（Tandem Mass Spectrometry，MS/MS）
2.5 檢測器
2.6 真空系統
Chapter3、液質聯用中的數據采集和分析
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