溶菌酶專性水解細菌細胞壁的特點,有助于了解細菌細胞壁的構造:將細胞壁分解后制備成的原生質體,可用于微生物分類以及微生物育種等學術研究。近年來,溶菌酶已成為細胞工程和基因工程必不可少的工具酶,用來提取和制造酶、核酸和活性多肽等。