診斷
炎癥腸病性關節炎的診斷不難，臨床上，當潰瘍性結腸炎和克羅恩病診斷明確，并出現外周關節炎和中軸關節病變，排除其他疾病即可診斷。
鑒別診斷
炎癥腸病性關節炎需與類風濕關節炎、銀屑病關節炎和強直性脊柱炎等相鑒別。
1．類風濕關節炎：本病以青中年女性多見，好發于四肢小關節，表現為對稱性多關節炎，關節呈梭形腫脹，常伴晨僵，可引起關節畸形，類風濕因子多陽性，X線片可見關節面粗糙和關節間隙狹窄，晚期可有關節面融合，一般不累及腸道。炎癥腸病性關節炎多于炎性腸病后出現，表現為少數非對稱性、一過性、游走性周圍關節炎，以膝、踝和足等下肢大關節受累為主，無晨僵，類風濕因子為陰性，X線片極少見關節破壞。
2.銀屑病關節炎：本病可累及脊柱和骶髂關節，也可表現為非對稱性關節炎，應與炎癥腸病性關節炎相鑒別。銀屑病關節炎常累及遠端指（趾）間關節、掌指關節和跖趾關節，伴銀屑病皮膚或指甲病變，去除皮疹鱗屑后為發亮的薄膜，除去薄膜可見點狀出血(Auspitz征)，多無消化道癥狀。
3．強直性脊柱炎：強直性脊柱炎臨床特點為腰背部不適、疼痛和晨僵，主要累及雙側骶髂關節及脊柱，呈對稱性，90%~95%患者HLA-B27陽性，無炎性腸病的消化道表現。炎性腸病性伴發的脊柱炎在癥狀、體征及X線片表現上難與特發性強直性脊柱炎鑒別，只是前者HLA-B27頻率（大約50%）比后者低，及潰瘍性結腸炎脊柱炎患者的HLA-Bw62頻率明顯增加。
值得注意的是，診斷炎性腸病時需與其他疾病包括缺血性結腸炎、顯微鏡下結腸炎、放射性腸炎、扭轉性腸炎、非甾類抗炎藥誘發性腸病、過敏性紫癜、惡性淋巴瘤和其他腫瘤相鑒別，其中，潰瘍性結腸炎與感染性、缺血性或藥物性結腸炎，克羅恩病與腸結核的鑒別尤為重要。一些難以與炎性腸病鑒別的疾病，甚至需3~6個月的隨訪觀察來明確診斷。
克羅恩病與腸結核的相互誤診率達50%以上。對克羅恩病的診斷應首先排除腸結核。有鑒別意義的臨床特征包括克羅恩病易累及肛周和形成腸瘺，腸結核患者可有腸外結核史。內鏡檢查克羅恩病多呈縱行潰瘍，而腸結核為橫行潰瘍。組織病理學方面，腸道和腸系膜淋巴結內小的、分散的和松散的非干酪性肉芽腫是克羅恩病特征；大的、致密的和融合的干酪樣肉芽腫和抗酸桿菌染色陽性是腸結核特征。亦可用特異性引物行聚合酶鏈反應(PCR)檢測組織腸結核DNA，腸結核陽性率達73.4%，不能除外腸結核時可試行抗結核治療4~8周。