1. 根據片段大小配制不同濃度的膠（改變分辨率），片段越小，需要膠濃度越大。
2. 膠要現制先用。
3. 選擇合適的Marker。
4. 配膠的緩沖液與電泳緩沖液要是同一種，且濃度一致（1倍）。
5. 點樣時要加入loading buffer，并注意，不要將樣點到點樣孔之外（飄樣），也不要將膠戳漏（漏樣）。
6. 根據片段大小，及電泳檢測目的，選擇合適的電壓及電泳時間。
7. EB染色。可選擇制膠時加入EB（要在溶玩膠后，且溫度至室溫時（用手握住制膠容器，不燙手即可））；或電泳結束后，將膠放入EB溶液中染色。