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  • 發布時間:2019-08-08 22:55 原文鏈接: 瓊脂糖電泳步驟之超級基礎篇

    一、電泳前準備

    準備內容

    作用

    1.刷干凈電泳制膠的梳子,板子,槽子,蒸餾水洗凈晾干

    防止不必要的重復污染,減少外來的污染。梳子干凈有利于梳孔的形成。

    2.檢查電泳槽,根據情況更換buffer

    排除電泳槽的電極接觸不良,確保buffer的緩沖能力,減少污染。

    3.根據DNA的分離范圍選擇合適的膠濃度并記錄

    達到較好的分離效果,防止樣過快跑出膠或者是過慢浪費時間。

    4.計算agarose的用量和制膠 buffer的用量記錄,膠最終越薄越好。

    實驗記錄備查

    二、制膠

    步驟

    注意事項

    1.稱量agarose和buffer

    Buffer不要用成H2O,稱量相對準確

    2.融膠,加熱到膠產生大量的氣泡時,拿出搖勻,繼續加熱到完全溶解,拿出搖勻,再加熱到沸騰。

    非常熱,小心燙手,另外注意不要加熱過度使膠沖出瓶子。因此注意選擇起碼為膠體積2倍以上的瓶子。保證膠混勻和完全溶解,減少可能因此引起的膠中孔徑不均勻影響分離效果。

    3.倒膠,可用水浴的辦法使膠冷卻到60度左右,即手可以握住瓶子的溫度,沿著制膠板的一側,緩緩地一次性倒入。梳子最好是預先放好并固定的,注意梳孔的體積能點的下所有的樣。用槍頭趕掉氣泡。

    制膠的桌面相對水平。倒膠時盡量減少氣泡的產生。EB如果在制膠時加入,在60度左右時加入,使終濃度為0.5ug/ml。不宜過低,染色成像不明顯;不宜過高,導致背景太深。搖勻要沿著瓶壁搖動,盡量減少氣泡產生的可能性。高濃度膠例如2%以上的EB很難搖勻,而且凝的速度也相對快,強烈建議跑完膠之后再用EB染色。

    4.室溫凝膠30分鐘

    過程中不要碰到梳子,盡量保持膠的位置不移動。時間不宜過久,導致膠干燥變形;不宜過短,影響膠內部孔徑形成。

    5.拔梳子,放入電泳槽。

    緩緩地將梳子垂直從梳孔拔出,盡可能使梳子是同時從各個膠孔拔出的。暫時不用的膠最好放入電泳槽電泳液中浸泡。電泳液要浸沒膠1mm。

    三、上樣電泳

    步驟

    注意事項

    1.樣品中加入loading buffer使其終濃度為1 X,混勻

    Loading buffer濃度不宜過低,點樣時樣品不能很好的沉在膠孔里;不宜過高,電泳時容易形成帶形的變形。注意混勻。

    2.點樣

    沿著膠孔的邊緣勻速加入。盡量避免碰壞膠孔。槍頭不要吸過多的氣泡,拔起時不要過猛帶出樣品。每點一個樣完,吸取buffer洗槍頭,避免樣品混雜。如果是有特殊要求,例如回收,強烈建議每點一個樣換一次槍頭。加樣的速度當然是越快越好,注意保證質量。點樣的量不要太大,一方面是體積不要太大,溢出污染鄰位樣品;一方面兩不要太大,容易導致脫尾和模糊不清。

    3.接通電源,選擇合適的電壓和時間電泳。

    膠孔與電極成水平狀態,防止樣品跑歪。跑膠期間不時回來看看,防止樣品跑出膠等意外發生。

    四、染色成像

    步驟

    注意事項

    1.染色

    如果膠中沒有加入EB,用0.5ug/ml的EB溶液浸染30分鐘。

    2.調整鏡頭的拍攝范圍和焦距,成像


    3.打印照片做分析記錄



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