6月22日,國際學術期刊Nucleic Acids Research在線發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所惠靜毅研究組題為YB-1 binds to CAUC motifs and stimulates exon inclusion by enhancing the recruitment of U2AF to weak polypyrimidine tracts的研究論文。該研究結果揭示了YB-1蛋白在調控3’剪接位點識別中的重要功能。
YB-1蛋白是一個多功能的DNA/RNA 結合蛋白,它在轉錄和翻譯調控中均能發揮重要作用。近年來的一些報道表明,YB-1是一個剪接體相關蛋白并參與可變剪接,但是它調控剪接的分子機制并不清楚。本項研究發現,YB-1能夠特異地結合含有CAUC或CACC核心序列的RNA,并證明了CAUC序列是一類新的剪接增強子。利用細胞表面吸附分子 CD44基因作為模型,研究闡明YB-1通過結合CD44可變外顯子5(v5)中和其上游多聚嘧啶位點中的CAUC序列促進外顯子v5剪接的作用方式。 U2AF65是識別3’剪接位點中多聚嘧啶區的關鍵剪接因子,有意思的是,U2AF65并不直接結合外顯子v5上游的多聚嘧啶區。進一步的實驗結果揭示了 YB-1識別CAUC序列,并通過直接結合U2AF蛋白招募U2AF65到弱的多聚嘧啶區,從而激活外顯子剪接的分子機制。
哺乳動物基因的3’剪接位點順序十分不保守,大量內含子的3’剪接位點中多聚嘧啶區缺乏U2AF65結合序列,這些3’剪接位點是如何被識別的一直是大家關心的問題。本項研究提示了其它RNA結合蛋白也可能通過這一方式參與了弱的3’剪接位點的識別,相關研究正在深入開展。
該課題由博士生魏文娟和牟世榮在惠靜毅研究員指導下完成,得到了科技部、國家自然科學基金委、中國科學院以及上海市科委等的經費資助。
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