生命科學專用色譜儀分類有多種。
1、按流動相物理狀態可分：氣相生命科學專用色譜儀和液相生命科學專用色譜儀。
2、按分離原理可分：生命科學專用分配色譜儀和生命科學專用凝膠色譜儀。
3、按色譜柱形狀可分：填充柱生命科學專用色譜儀和毛細管柱生命科學專用色譜儀。
4、按固定相和流動相的極性大小可分：正相生命科學專用色譜儀和反相生命科學專用色譜儀。
5、按進樣自動性可分：自動進樣生命科學專用色譜儀和手動進樣生命科學專用色譜儀。
6、按進樣器可分：針進樣生命科學專用色譜儀、閥進樣生命科學專用色譜儀和自動進樣器進樣生命科學專用色譜儀。