| 實驗步驟 | 一、搜索生物信息學數據庫或者軟件
數據庫是生物信息學的主要內容，各種數據庫幾乎覆蓋了生命科學的各個領域。
核酸序列數據庫有GenBank， EMBL， DDB等，
蛋白質序列數據庫有SWISS-PROT， PIR，OWL， NRL3D， TrEMBL等，
蛋白質片段數據庫有PROSITE， BLOCKS，PRINTS等，
三維結構數據庫有PDB， NDB，BioMagResBank，CCSD等，
與蛋白質結構有關的數據庫還有SCOP， CATH， FSSP， 3D-ALI， DSSP等，
與基因組有關的數據庫還有ESTdb，OMIM，GDB， GSDB等，
文獻數據庫有Medline， Uncover等。
另外一些公司還開發了商業數據庫,如MDL等。
生物信息學數據庫覆蓋面廣，分布分散且格式不統一, 因此一些生物計算中心將多個數據庫整合在一起提供綜合服務，如EBI的SRS(Sequence Retrieval System)包含了核酸序列庫、蛋白質序列庫，三維結構庫等30多個數據庫及CLUSTALW、PROSITESEARCH等強有力的搜索工具，用戶可以進行多個數據庫的多種查詢。
二、搜索生物信息學軟件
生物信息學軟件的主要功能有：分析和處理實驗數據和公共數據，加快研究進度，縮短科研時間；提示、指導、替代實驗操作，利用對實驗數據的分析所得的結論設計下一階段的實驗；尋找、預測新基因及預測其結構、功能；蛋白高級結構預測。如：核酸序列分析軟件BioEdit、DNAClub等；序列相似性搜索BLAST；多重系列比對軟件Clustalx；系統進化樹的構建軟件Phylip、MEGA等；PCR 引物設計軟件Primer premier6.0、oligo6.0等；蛋白質二級、三級結構預測及三維分子瀏覽工具等等。 展開 |
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