利用分子大小不同的物質在流過凝膠固定相時的保留時間不同,大分子首先流出,小分子最后流出,可將待測小分子化合物與大分子蛋白質分離。這時待測小分子化合物的濃度被流動相所稀釋,必要時還要進行濃縮后再用色譜分析。