酶類
重要的為氧化酶和脫氫酶兩類，脫氫酶尤為重要。
氧化酶為含銅或鐵的蛋白質，能激活分子氧，促進氧對代謝物的直接氧化，只能以氧為受氫體，生成水。重要的有細胞色素氧化酶，可使還原型氧化成氧化型，亦可將氫放出的電子傳遞給分子氧使其活化。心肌中含量甚多。此外還有過氧化物酶、過氧化氫酶等。
脫氫酶分需氧脫氫酶和不需氧脫氫酶。前者可激活代謝物分子中的氫，與分子氧結合，產生過氧化氫。在無分子氧時，可利用亞甲藍為受氫體。需氧脫氫酶皆以FMN或FAD為輔酶。不需氧脫氫酶可激活代謝物分子中的氫，使脫出的氫轉移給遞氫體或非分子氧。一般在無氧或缺氧環境下促進代謝物氧化。大部分以NAD或NADP為輔酶。
體系
有不需傳遞體和需傳遞體的兩種體系。
不需傳遞體的最簡單，在微粒體、過氧化酶體及胞液中代謝物經氧化酶或需氧脫氫酶作用后脫出的氫給分子氧生成水或過氧化氫。其特點是不伴磷酸化，不生成ATP，主要與體內代謝物、藥物和毒物的生物轉化有關。
需傳遞體的最典型的是呼吸鏈。是在線粒體經多酶體系催化，即通過電子傳遞鏈完成，與ATP的生成相關。