隨后質譜在電離技術和分析技術上的發展和完善，使之很快應用于地質、空間研究、環境化學、有機化學、制藥等多個領域。然而，即使在等離子體解吸（plasma desorption,PD）和快原子轟擊（fast atom bombardment,FAB）兩項軟電離質譜技術出現以后，質譜分析的相對分子質量也只是在幾千左右。真正意義上的變革以80年代中期出現的兩種新的電離技術：電噴霧電離（electrospray ionization,ESI）和基質輔助激光解吸電離（matrix-assisted laser desorption ionization,MALDI）為代表，這兩種技術所具有的高靈敏度和高質量檢測范圍，使得在fmol （10-15）乃至amole（10-18）水平檢測相對分子質量高達幾十萬的生物大分子成為可能，從而開拓了質譜學一個嶄新的領域——生物質譜，促使質譜技術在生命科學領域獲得廣泛應用和發展。