• <table id="4yyaw"><kbd id="4yyaw"></kbd></table>
  • <td id="4yyaw"></td>
  • 發布時間:2019-09-10 13:10 原文鏈接: 用于基因組文庫中的真核DNA的部分酶切(預反應)實驗

               

    實驗方法原理 不管高分子質量 DNA 的堿基組成與序列如何,通過水壓機械剪切(hydrodynamic shearing) 均可將其以半隨機形式片段化。但是,用這種方法制備的 DNA 需進行一系列酶反應操作(末端修復、甲基化、接頭連接、接頭消化)以保護內部限制位點,以及產生一些黏性末端。
    實驗材料

    限制性內切核酸酶 基因組 DNA λ 噬菌體 DNA 質粒寡聚體

    試劑、試劑盒

    蔗糖凝膠上樣緩沖液 Tris-Cl

    儀器、耗材

    瓊脂糖凝膠 毛細管 透析袋 水浴 寬口移液尖頭

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液和溶液

    蔗糖凝膠上樣緩沖液

    Tris-Cl (10 mmol/L, pH 8.0)

    2. 酶和緩沖液

    限制性內切核酸酶

    3. 凝膠

    瓊脂糖凝膠(0.6%),用 0.5X TBE,含 0.5 μg/ml 溴化乙錠

    瓊脂糖凝膠,用于脈沖場凝膠電泳

    4. 核酸和寡核苷酸

    基因組 DNA,高分子質量

    λ 噬菌體 DNA 和質粒寡聚體

    5. 專用設備

    毛細管,封口

    透析袋,煮過

    預置于 70℃ 的水浴

    寬口移液尖頭

    二、方法

    1. 利用將被用于制備克隆片段的同一份基因組 DNA 建立預實驗。

    (1) 將 30 μg 高分子質量真核 DNA 用 10 mmol/L Tris-Cl (pH 8.0) 稀釋至 900 μl,加入 100 μl 適當的 10X 限制酶緩沖液。

    (2) 用一個封口的玻璃毛細管將溶液輕輕混勻,確保高分子質量 DNA 已完全均勻地分布于限制酶緩沖液中。

    (3) 混勻后,將稀釋 DNA 于室溫放置 1 h,使殘余的 DNA 聚集塊能徹底地解散。

    2. 用 1 至 10 標記微量離心管。用一寬口的玻璃毛細管或一次性塑料移液器尖頭將 60 μl DNA 溶液轉移至一微量離心管中(第 1 管 )。轉移 30 μl DNA 溶液至其他標記的 9 個微量離心管中。冰浴放置。

    3. 加 2 單位適當的限制酶至第 1 管中。

    4. 用一新鮮的移液尖頭將第 1 管中 30 μl 反應液轉移至系列離心管的第 2 管內。如前所述混勻,繼續轉移至下一個離心管中。在第 10 管中不加任何東西(無酶對照),同時從第 9 管中取出 30 μl 舍棄。

    5. 37℃ 溫育 1 h。

    6. 70℃ 加熱 15 min,使酶失活。

    7. 將反應冷卻至室溫,加入適當量的蔗糖凝膠上樣緩沖液。

    8. 用寬口塑料移液尖頭或一次性玻璃毛細管將溶液轉移至 0.6% 瓊脂糖凝膠的點樣孔內,更好的是轉移至脈沖場凝晈電泳的上樣槽中,隨后進行電泳。

    9. 將消化的真核 DNA 大小與含 λ 噬菌體和質粒寡聚體的 DNA 標準進行比較。鑒別能獲得大量理想大小基因組 DNA 的部分酶切條件。


                展開


  • <table id="4yyaw"><kbd id="4yyaw"></kbd></table>
  • <td id="4yyaw"></td>
  • 调性视频