對具有正常完整防御功能的人,暗色真菌極少引起致死性感染。威脅生命的疾病常發生于免疫受損的患者。伊曲康唑盡管不是對所有的病人都有效,但仍是最有效的抗真菌藥。有時可用氟胞嘧啶輔助性治療,因為雖然有一些病變可能反應快,但常會復發。氟康唑很少可使病變消退,兩性霉素B也無效。許多病例需外科切除方能治愈。