結節病大都預后良好。Ⅰ期胸內結節病患者，2年內自行消退者達60%～80%。但是Ⅱ期、Ⅲ期患者自行緩解率減少，Ⅲ期患者僅為30%，大多最終導致肺纖維化，重者可發生肺心病和呼吸衰竭。一般來說，若2年后才開始治療，治療效果甚差，因此應爭取早期治療。
糖皮質激素至今仍是治療結節病的首選藥物。在重要器官，如眼、中樞神經、心肌、肺部有彌漫性結節病變患者，或有脾功能亢進、高鈣血癥時均應選用。糖皮質激素治療相對適應證：
①進行性或有癥狀的肺門結節病。
②有明顯的自覺全身癥狀者。
③皮膚破潰和淋巴結病變。
④關節、鼻、咽和支氣管黏膜病變。一般選用潑尼松或潑尼松龍治療，開始每天用量30～40mg，4～6周，有效者可逐漸減量，每天20mg時，可用8～12周，維持量5～10mg/d，1年或更長。近年有人對僅有肺內結節病的患者，于口服糖皮質激素減量時，加用吸入糖皮質激素，用量800～1250μg/d，以順利減少口服糖皮素激素用量，從而鞏固療效，減少口服糖皮質激素的副作用。若糖皮質激素無效，也可選用小劑量硫唑嘌呤或甲氨蝶呤等細胞毒藥物。有報道選用氯喹治療皮膚和黏膜結節病者，劑量開始為500mg，1次/d、共2周，以后每天服用250mg，連續應用半年，此種方法尚需進一步驗證。