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  • 發布時間:2020-08-10 17:55 原文鏈接: 用隨機寡核苷酸引物從mRNA合成cDNA探針

    實驗方法原理 本方案以 poly(A) + RNA 作為模板,通過隨機引物反應合成 cDNA 探針,這類探針可用于 cDNA 文庫的差異篩選。

    實驗材料 反轉錄酶反轉錄酶緩沖液隨機脫氧核苷酸引物模板 mRNA

    試劑、試劑盒 乙酸銨DTTEDTA乙醇HClNaOH酚氯仿胰 RNA 酶抑制劑SDS Tris-CldNTP 溶液

    儀器、耗材 冰水浴Sephadex G-50 離心柱水浴或加熱板

    實驗步驟

    一、材料


    1. 緩沖液與溶液


    乙酸銨(10 mol/L)


    DTT (1 mol/L)


    EDTA ( 0.5 mol/L,pH 8.0)


    乙醇


    HCl ( 2.5 mol/L)


    NaOH ( 3 mol/L)


    酚:氯仿(1:1,V/V)


    胰 RNA 酶抑制劑(20 單位/μl )


    SDS ( 10% m/V)


    Tris-Cl ( 1 mol/L,pH 7.4)


    2. 酶和緩沖液


    反轉錄酶


    10X 反轉錄酶緩沖液


    3. 核酸與寡核苷酸


    含有 dATP、dGTP 和 dTTP 各 20 mmol/L 的 dNTP 溶液


    dCTP ( 125 μmol/L)


    長度為六或七個堿基的隨機脫氧核苷酸引物


    模板 mRNA


    4. 放射性化合物


    [α-32P] dCTP ( 10 mCi/ml,比活性為 >3000 Ci/mmol)


    5. 專用設備


    冰水浴


    Sephadex G-50 離心柱,平衡于 TE(pH 7.6)


    預熱至 45℃、68℃ 和 70℃ 的水浴或加熱板


    二、方法


    1. 將 1 μg poly(A)+RNA 轉移至消毒的微量離心管。用無 RNA 酶的水將溶液的體積調至 4 μl。蓋緊微量離心管蓋,于 70℃ 加熱 5 min,然后迅速將離心管轉至冰水浴中。


    2. 在微量離心管的冷溶液中加入:


    10 mmol/L DTT                                    2.5 μl


    胎盤 RNA 酶抑制劑                              20 單位


    隨機脫氧寡核苷酸引物                          5 μl


    10X 反轉錄緩沖液                                 2.5 μl


    20 mmol/L dGTP、dATP 和 dTTP 溶液  1 μl

     

    125 μmol/L dCTP 溶液                          1 μl


    10 mCi/ml [α-32P] dCTP


    ( 比活性為 > 3000 Ci/mmol)                  10 μl


    無 RNA 酶的水                                     加至 24 μl


    反轉錄酶(200 單位)                          1 μl


    3. 加入下列試劑以終止反應:


    0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0)                1 μl


    10% (m/V)SDS                          1 μl


    充分混合管中的試劑。


    4. 在反應管中加入 3 μl 3 mol/L NaOH,68℃ 溫育混合物 30 min 以水解 RNA。


    5. 使反應混合物的溫度冷卻至室溫,加入 10 μl 1 mol/L Tris-Cl(pH 7.4)以中和溶液,混勻,然后加入 3 μl 2.5 mol/L HCl。取極小量液體滴在 pH 試紙上,以檢測溶液的 pH。


    6. 用酚:氯仿抽提純化 cDNA。


    7. 用離心柱層析或在 2.5 moI/L 醋酸銨存在下用乙醇選擇性地沉淀放射性標記的探針以與未摻入的 dNTP 分離。


    8. 用三氯乙酸(TCA)沉淀法或 DE-81 濾膜結合法來確定放射性標記 dNTP 摻入的比例。


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