甲醛變性凝膠電泳鑒定RNA實驗

瓊脂糖凝膠電泳作為鑒定大分子物質經常被使用, 但含有RNase 酶活性, 因此要使RNase 變性而不使RNA 變性的, 故采用甲醛變性凝膠電泳鑒定RNA。

RNA

MOPS 乙酸鈉 EDTA 蔗糖 EDTA 溴酚藍 二甲苯青 甲醛

電泳槽 電泳儀

1.  制備凝膠: 瓊脂糖濃度1 . 2% , 加入5×甲醛凝膠電泳緩沖液和甲醛, 使兩者的終濃度分別為1×甲醛凝膠電泳緩沖液和2.2 mol/ L;

2.  取一定量的RNA 樣品, 加入5 × 甲醛凝膠電泳緩沖液2 . 0 μl , 37%甲醛3 . 5 μl , 去離子甲酰胺10 . 0 μl , 稍微離心混勻后置65 ℃水浴15 min , 然后迅速置于冰浴中5 min; 加入2 . 0 μl 加樣緩沖液, 稍微離心;

3.  上樣前, 凝膠在1 × 甲醛凝膠電泳緩沖液預電泳5 min(電壓5 V/ cm) ;

4 . 將樣品加到凝膠樣品孔, 以4 V/ cm 電壓進行電泳; 每隔30 min 將陰陽電極液混勻, 然后繼續電泳;

5.  電泳結束后, 將膠放入0 . 5 μg/ ml 的EB 溶液中, 染色30 min; 紫外觀察。