電泳遷移率變動分析的應用

用于研究特定的轉錄因子以及轉錄因子所結合的順勢作用元件。 

用于研究與蛋白質相結合的DNA的序列的特異性。

評估突變對探針DNA與結合蛋白相互作用的影響。 

用于研究DNA-foot printing。