1.睪丸鞘膜積液
體格檢查腫塊有囊性感、質韌、有彈性，透光試驗陽性，但鞘膜壁厚或部分鈣化時不易鑒別。男性細胞瘤有時可發生少量鞘膜積液，但有沉重感，透光試驗陰性。B超、CT檢查有助于鑒別。
2.急性附睪、睪丸炎
附睪、睪丸腫大可與男性細胞瘤相混淆，但病人有畏寒、高熱，局部疼痛較重，睪丸觸痛明顯，并常累及輸精管。血白細胞增高。
3.睪丸血腫
有外傷史，體格檢查陰囊有淤血斑。B超檢查示睪丸回聲內出現低回聲區。
4.附睪結核
可累及睪丸，產生結節，與男性細胞瘤相混淆。但附睪結核常常累及輸精管，形成串珠樣結節。附睪尾部的病灶可與陰囊皮膚粘連形成竇道。
5.睪丸扭轉
臨床表現以突發性睪丸劇痛、腫脹、壓痛為特征。體格檢查睪丸位置常在陰囊上部，彩色多普勒超聲和動態放射性核素掃描顯示血流量明顯減少或消失。
6.精液囊腫
精液囊腫是精子集聚所形成的位于睪丸附睪部的囊腫，多發生于青壯年，病史長，進展慢。腫塊界限較清。透光試驗陽性。B超、CT檢查示腫塊為液性。