常見病因為心肌病、冠心病、心肌炎，亦見于結締組織病、代謝或浸潤性疾病，不少病例病因不明。除竇房結及其鄰近組織外，心臟傳導系統其余部分，也可能受累，引起多處潛在起搏點和傳導功能障礙。當合并房室交接處起搏或傳導功能障礙時，又稱雙結病變。如同時累及左、右束支時，稱為全傳導系統病變。
病竇綜合征中大多數的病程發展緩慢，從出現癥狀到癥狀嚴重可長達5～10年或更長。少數急性發作，見于急性心肌梗死和急性心肌炎。
