根據傳播途徑和病變部位的不同可分為以下類型。
呼吸道病毒性疾病
①病毒性呼吸道感染。包括鼻病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒和冠狀病毒等的感染。②流行性感冒。③流行性腮腺炎等。
胃腸道病毒性疾病
①脊髓灰質炎。②庫克薩基病毒感染。③ECHO病毒感染。④病毒性胃腸炎。包括輪狀病毒性胃腸炎、諾瓦克病毒性胃腸炎、腺病毒性胃腸炎、星狀病毒性胃腸炎、冠狀病毒性胃腸炎和杯狀病毒性胃腸炎等。
肝臟病毒性疾病
包括甲型病毒性肝炎、乙型病毒性肝炎、丙型病毒性肝炎、丁型病毒性肝炎、戊型病毒性肝炎、EB病毒性肝炎和巨細胞病毒性肝炎等。
皮膚和粘膜病毒性疾病
包括麻疹、風疹、幼兒急疹、水痘及帶狀皰疹、天花、單純皰疹病毒感染、狂犬病和口蹄疫等。
眼病毒性疾病
包括流行性角膜結膜炎、濾泡性結膜炎和皰疹性角膜結膜炎等。
中樞神經系統病毒性疾病
包括流行性乙型腦炎、西方馬腦炎、東方馬腦炎、圣路易腦炎、委內瑞拉馬腦炎、墨累山谷腦炎、加利福尼亞腦炎、森林腦炎和淋巴細胞脈絡叢腦膜炎等。
親淋巴細胞性病毒性疾病
包括傳染性單核細胞增多癥、巨細胞病毒感染和獲得性免疫缺陷綜合征等。
蟲傳病毒性疾病
有以下多種：①病毒性出血熱。包括流行性出血熱、黃熱病、克里米亞－剛果出血熱、裂谷熱、阿根廷出血熱、玻利維亞出血熱、拉薩熱、鄂木斯克出血熱、馬爾堡病和埃波拉出血熱等。②登革熱和登革出血熱。③西尼羅熱。④科羅拉多蜱傳熱。⑤白蛉熱等。
慢病毒感染
包括亞急性硬化性全腦炎、庫魯病、進行性多灶性白質腦病和亞急性海綿樣腦病（皮質紋狀體脊髓變性）等。