以血氧水平(BOLD)依賴為基礎的fMRI技術是一項比較成熟和完善的腦功能成像研究方法，目前主要應用于腦功能區(運動、語言、感覺功能)的術前定位。
腦磁圖(magnetoencephalography,MEG)是近年來發展起來的一種無創腦功能檢測方法，它是用低溫超導來檢測腦內生物磁信號的，時間分辨率達到1毫秒、空間分辨率高，腦磁圖可以進行癲癇灶定位與功能區定位，可以檢測直徑小于3mm的癲癇灶。MEG主要記錄發作間期的磁信號，對于大腦皮層起源的癲癇灶檢出率高，對于深部起源的癲癇灶定位不夠敏感。
