百日咳是由革蘭染色陰性百日咳桿菌引起的急性呼吸道傳染病。人群普遍易感，病人或隱性感染者為本病傳染源。潛伏期為7～14日，最長21日，典型病例病程6～8周。臨床分期分為卡他期和痙咳期：
卡他期：指發病至陣咳出現，約7～10日，有低熱、流涕、噴嚏、單聲咳嗽，3～4日后癥狀減輕，唯咳嗽加劇，漸呈痙咳狀。
痙咳期：一般持續2～6周，也可長達“百日”之久，以陣發性痙攣性咳嗽以及痙攣性咳嗽終止時，伴有高音調雞鳴樣吸氣吼聲為主要特征。痙咳時，雙手握拳，屈肘，雙眼圓睜，張口伸舌，面紅耳赤，涕淚交加，頭向前傾，嘴唇發紺，重者甚至大小便失禁，直至咳出黏稠痰液或嘔吐后，方可緩解。其后可玩耍如常，如此反復發作，一日數次，甚至數十次，以夜間更為明顯。痙咳時間較長。患兒可出現舌系帶潰瘍、鼻出血、眼結膜下出血等。
中醫辨治
中醫學對本病早有記載，隋巢元方《諸病源候論》關于“頓咳”、“肺咳”等亦與近代之百日咳癥狀極近似。如“咳而引頸項，唾涎沫，引舌本”，這是百日咳具有的特殊癥狀。朱丹溪《幼科全書》更突出地指出了“如咳久連聲不已，且口鼻俱出血……小兒咳嗽日久，一連百數十聲不止，晝夜如此，面色白光
白，目光無神采，氣急痰壅，體虛發熱，至此則不治”。至明代，醫家據其咳嗽陣作的特點，又稱為“硬咳”，因咳時伴回吼聲，故稱“鷺鷥咳”、“雞喉”。鑒于其咳嗽時日長，又稱之為“虛咳”，因其具有傳染性，故謂“疫咳”。總之，本病大抵屬于中醫“頓咳”、“時行頓咳”、“天哮”、“百日咳”、“疫咳”、“雞喉”、“虛咳”等疾病范疇。
根據本病由表及里，痰濁戀肺，耗陰傷氣的病理特點，臨床可分如下三期論治。
1.初咳期
癥狀：咳嗽初起似外感，但有逐漸加劇之勢，常有流涕，痰白而稀，多泡沫。舌苔薄白，脈浮有力，指紋淡紅。
治法：宣肺化痰。
方藥：金沸草散加減：旋覆花（包煎）、前胡、川貝各10克；荊芥、百部、半夏各6克，細辛3克。偏于風寒者，加麻黃3克，杏仁6克；偏于風熱者，加桑葉、菊花各10克。
2.痙咳期
癥狀：咳嗽頻作，咳后有回吼聲，反復不已，入夜尤甚，痰多而黏，嘔吐后陣咳暫停，神煩面赤，大便于，小便黃。舌苔微黃，脈數有力，指紋紫滯。
治法：清熱瀉肺，化痰止咳。
方藥：桑白皮湯加減：桑白皮、黃芩、川貝、法夏、蘇子、杏仁、山梔各10克，黃連3克。痙咳頻作者，酌加白僵蠶10克，蜈蚣兩條解痙鎮咳；嘔吐頻繁者，加代赭石、枇杷葉、紫石英、竹茹各10克以降逆止嘔；若痰多而喘者，可選加蘇子、膽南星各10克，地龍8克以除痰定喘；如見嗆咳、痰少、舌紅苔凈者，去黃芩、黃連，加北沙參、天冬、麥冬各10克以潤肺養陰；咳血者，加鮮蘆根、側柏葉、白茅根各15克，紅景天、三七各10克以涼血止血；雙目紅腫者，加龍膽草10克清瀉肝火；脅肋疼痛者，加柴胡、郁金、桃仁各10克疏肝活血止痛。
3.恢復期
陣發性痙咳漸減輕，雞鳴樣回聲漸消失。臨床又分氣虛、陽虛兩型。
（1）氣虛型
癥狀：形體虛弱，咳聲低微，痰少而稀，手足欠溫，神疲，面色白光 白，自汗無力，納呆，大便溏，小便清長。舌淡，苔薄白，脈細弱，指紋淡紅。
治法：益肺健脾。
方藥：人參五味湯加減：黨參12克，茯苓、白術各10克，甘草3克，生姜3片，大棗7枚，五味子、麥冬各8克。多汗易感冒者，加黃芪15克，防風10克益氣固表。
（2）陰虛型
癥狀：干咳無力，手足心熱，聲音嘶啞，夜寐不安，神煩盜汗，頰赤唇干。舌紅苔薄少，脈細數，指紋淡紫。
治法：養陰潤肺。
方藥：沙參麥冬湯加味：沙參、玉竹、麥冬、杏仁各10克，桑葉、桔梗各6克，花粉15克，甘草3克。痰黏不易咯出、大便干結者，加全瓜蔞15克化痰通便；午后潮熱者，加銀柴胡12克清虛熱；多汗者加牡蠣、淮小麥各15克以斂陰止汗。
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單秘驗方
1.百部：有止咳、抑制百日咳桿菌的功效。單味煎服或以百部為主的復方，治療百日咳療效顯著。單味百部每次3克，每日3次，加水煎服，7～10天為一療程。
2.白厥菜：為治療百日咳較為有效的藥物。取其干品制成含生藥100％的糖漿，半歲以內患兒每次5～8毫升，半歲至一歲每次服8～10毫升，1～3歲每次服10～15毫升，3～6歲每次服15～20毫升，6歲以上者每次服20～30毫升。每日3次，8～10日為一療程。病重者可酌情加量。
3.大蒜：以紫皮蒜為佳，可制成50％的糖漿，每次10毫升，5歲以上者每次20毫升。每日3次，連用7天，對百日咳療效甚佳。
4.鵝不食草：10～20克，水煎分3次服，治療百日咳，可解毒止咳。
5.扛板歸全草：每次10～20克，每日3次，水煎服，可清熱解毒，治療百日咳有效。
6.車前草：全草入藥，取鮮草100克搗汁，開水沖服。每日2～3次，7天為一療程，可止咳祛痰。
7.蚱蜢：將其焙干研為細末，每次1～2克，每日3次，口服，可鎮咳平喘。
其他療法
以下治療方法，對百日咳均有輔助治療作用，可在藥物治療的同時適當選用。
1.針刺：取穴尺澤、合谷，每日針刺一次，7日為一療程。有止咳化痰之功。
2.梅花針：刺激頸、骶之脊旁3～4厘米區域，每日一次。
3.火罐：于身柱穴處拔火罐，每日一次。
4.推拿：運八卦，掐合谷，推肺經，掐揉二扇門，掐揉五指節，推脾胃，掐合谷，揉魚際，揉太淵，掐尺澤，每日一次。
5.擦法：將鮮生姜或大蒜切破，與黏蝸牛液或雞蛋清混勻，在胸骨部由上而下涂擦。每日兩次，每次數分鐘。
6.飲食治療
（1）本病初起及痙咳期：宜選用清淡易消化食物，多食鮮蔬菜、鮮水果、杏仁、枇杷等。
（2）病情恢復期：肺之氣陰受傷，可分別選用下列食療方，輔助治療。①胡桃人參湯：胡桃肉（不去皮）20克，西洋參6克，生姜3片，加水適量，同煎取汁200毫升去姜，加冰糖少許調服。每日一次，臨睡前溫服。②杏仁蓮藕湯：杏仁10克，鮮藕30克，用冰糖熘熟頓服，每日睡前一次。③白梨湯：白梨50克，冬蟲夏草5克，水煎服，每日一次。④果仁膏：枇杷果、枸杞果、黑芝麻、核桃仁各50克，熬成膏，每晚服用一勺。（摘自《傳染病中西醫診療技術》）