百級超凈工作臺根據氣流的方向分為垂直流百級超凈工作臺和水平流百級超凈工作臺，垂直流工作臺由于風機在頂部所以噪音較大但是風垂直吹多用在醫藥工程這樣有利于人利的身體健康;水平流工作臺噪音比較小風向往外所以多用在電子行業，對身體健康影響不大。
根據操作結構分為單邊操作及雙邊操作兩種形式，按其用途又可分為普通百級超凈工作臺和生物(醫藥)百級超凈工作臺；
從操作人員數上分為單人超凈臺和雙人超凈臺;從結構上分為下吸風和上吸風兩種;從送風又分為水平送風與垂直送風。
